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中國藥學會成立于1907年，是中國最早成立的學術團體之一，是由全國藥學科學技術工作者自愿組成依法登記成立的學術性、公益性、非盈利性的法人社會團體，是黨和政府聯系我國藥學科學技術工作者的橋梁和紐帶，是國家推動藥學科學技術和民族醫藥事業健康發展，為公共健康服務的重要力量。中國藥學會是國際藥學聯合會和亞洲藥物化學聯合會成員。現有注冊會員8萬多人，高級會員3000余人，團體會員53個。學會下設7個工作委員會，19個專業委員會，主辦20種學術期刊。
　　

中國藥學會的宗旨是堅持以馬克思列寧主義、毛澤東思想、鄧小平理論和“三個代表”重要思想為指導，全面落實科學發展觀。堅持科學技術是第一生產力的思想，團結和組織廣大藥學科學技術工作者，實施科教興國和可持續發展戰略，促進藥學科學技術的普及、繁榮和發展，促進藥學人才的成長和提高，促進藥學科學技術與經濟的結合，為我國社會主義現代化建設服務，為構建社會主義和諧社會服務。維護藥學科學技術工作者的合法權益，為會員和藥學科學技術工作者服務。

中國藥學會的主要任務是開展藥學科學技術的國內外學術交流；編輯出版、發行藥學學術期刊、書籍；發展同世界各國及地區藥學相關團體、藥學科學技術工作者的友好交往與合作；舉薦、表彰、獎勵在科學技術活動中取得優異成績的藥學科學技術工作者；開展對會員和藥學科學技術工作者的繼續教育培訓；普及推廣藥學以及相關學科的科學技術知識；反映藥學科學技術工作者的意見和要求，維護藥學科學技術工作者的合法權益；接受政府委托，承辦與藥學發展及藥品監督管理等有關事項，組織藥學科學技術工作者參與國家有關項目的科學論證和科學技術咨詢；開展醫藥產品展示、提供醫藥技術服務與推廣科研成果轉化等活動；舉辦為會員服務的事業和活動；依法興辦符合本會業務范圍的事業與企業單位。
　　

中國藥學會主管單位為中國科學技術協會，辦事機構為秘書處，行政掛靠國家食品藥品監督管理局。秘書處內設辦公室、組織工作部、學術部、編輯出版部、繼續教育與科普部、國際交流部、科技開發中心。